Prima di iniziare ad utilizzare Mon Ami 3000 è consigliabile inserire tutte le informazioni che verranno utilizzate durante il normale svolgimento del proprio lavoro. Questi dati saranno proposti automaticamente dal software nelle varie finestre velocizzando notevolmente l'inserimento delle registrazioni.
Tutti i dati di base utilizzati nelle varie finestre del programma si trovano in Impostazioni > Configurazione.
Al momento della creazione di una nuova azienda vengono precaricate delle impostazioni predefinite, tuttavia non è detto che tali dati predefiniti possano essere validi per qualsiasi realtà aziendale e quindi possono essere modificati tramite la schermata sottostante.
La schermata consente, tramite delle opzioni, di attivare e impostare la gestione di articoli, documenti, magazzino, produzione e contabilità; inoltre consente anche di eseguire delle impostazioni di carattere generale.
Per ogni gestione è possibile abilitare e configurare una serie di funzionalità avanzate che la riguardano.